Les sonates pour flûte ont été écrites entre 1715 et 1725 quand Jean-Sébastien Bach était le recteur de la musique de chambre du Prince Léopold de Köthen. Elles ne forment pas un corpus homogène comme les suites, sonates pour clavier et violon, viole de gambe, violon ou violoncelle seul, et correspondent à une période créatrice différente, sans la volonté du compositeur de les rassembler. C'est l'édition du XIXe siècle qui les a présentées ensemble. Conçues pour la flûte traversière, elles sont néanmoins jouées aussi à la flûte douce. Le continuo, s'il est présent, est généralement constitué d'un clavecin et d'une basse, violoncelle ou viole de gambe.
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